L´ISA, depuis 1967, délivre le diplôme d´Ingénieurs pour la Terre, reconnu par l'Etat et par la Commission du Titre d´Ingénieur (CTI). Depuis 2001, le diplôme est dénommé "Diplôme d´ingénieur de l´ISA".
À partir de 1986, l´ISA, en réponse à la demande du monde de l´entreprise, a créé d´autres formations pour Bac+2 et Bac+3 :
Agroqual*, licence par alternance. Objectif : former des techniciens compétents dans l’organisation et la gestion de la production et de la qualité des produits alimentaires.
Master in Industrial Biotechnology Management*, Master professionnel de Sciences et Technologies Parcours Agroalimentaire, Cycle d´enseignement supérieur en industries agroalimentaires. Objectif : former des cadres dans les métiers de l’hygiène, de la qualité, de la sécurité et de l'environnement en agroalimentaire.
Environnementaliste*, Licence et Master de Sciences et Technologies Parcours « Environnementaliste ». Objectif : former des responsables de projet à la fois polyvalents et dotés de connaissances pointues et opérationnelles dans les différents domaines de l’environnement au sens large.
L´ISA est également à l´origine d´une autre école d´ingénieur dont elle délivre le diplôme, l´ITIAPE, l´Institut des Techniques de l´Ingénieur en Aménagement Paysager de l´Espace, en partenariat avec l´UNEP (Union national des entrepreneurs du paysage) et l´institut de Genech.
Enfin pour suivre l'évolution et accompagner les entreprises, l'ISA a créé des formations à l'international comme Isfrada (Roumanie) ou Cheng (Chine).
* Ces formations sont réalisées conjointement avec la Faculté Libre des Sciences et Technologies de Lille.